Ο Ιερός Ναός του Αγίου Ιωάννου του Θεολόγου μνημείο μεταβυζαντινής εποχής, υπήρξε επί σειρά ετών παρεκκλήσιον της Ενορίας του Αγίου Γεωργίου Άρτης. Με την υπ᾽ αριθμ. 19/26-9-1977 πράξη του Εκκλησιαστικού Συμβουλίου της ανωτέρω ενορίας, ο ιερός ναός παραχωρήθηκε δωρεάν στην Ιερά Μητρόπολη Άρτης για την εκπλήρωση των Θρησκευτικών, πνευματικών και φιλανθρωπικών σκοπών αυτής. Ο ναός υπέστη σοβαρές ζημιές από πυρκαγιά στις 3 Μαΐου 1968, τις οποίες ανέλαβε να διορθώσει ο νεοσύστατος τότε θρησκευτικός Σύλλογος «Άγιος Ιωάννης ο Θεολόγος».
Η τελευταία ανακαίνιση του ναού έγινε το 2011, παράλληλα με τις εργασίες ανακαίνισης του Πνευματικού Κέντρου.